7种DNA连接酶的作用及特点
发布时间:2025-03-11
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作者:东极药物
DNA连接酶是生物体内重要的酶,其所催化的反应在DNA的复制和修复过程中起着重要的作用。今天我们就来了解一下这7种分子生物学实验中常见的DNA连接酶吧!一、T4 DNA Ligase作用:主要连接平末端或粘性末端,并修复双链···
DNA连接酶是生物体内重要的酶,其所催化的反应在DNA的复制和修复过程中起着重要的作用。
今天我们就来了解一下这7种分子生物学实验中常见的DNA连接酶吧!
一、T4 DNA Ligase
作用:主要连接平末端或粘性末端,并修复双链DNA和一些DNA/RNA杂交体中的单链缺口,在5'磷酸基和3'羟基之间形成磷酸二酯键。
特点:反应条件为4~37°℃,分子克隆中多选择16°C或25°℃,需要ATP(通常包含在buffer中)。
二、T3 DNA Ligase
作用:能够催化双链DNA中临近的5'磷酸和3羟基之间形成磷酸二酯键,且对A/T突出末端的连接效率高于C/G末端。
特点:与T4 DNA ligase相比,可耐受高盐buffer;需要ATP(通常包含在buffer中)。
三、T7 DNA Ligase
作用:仅可催化形成双链DNA相邻粘性末端5'磷酸和3羟基磷酸二酯键,但不能有效催化平末端双链DNA的连接,加入大于或等于20%的PEG6000可以适当提高该酶的平末端DNA连接活性。
特点:反应底物为粘性末端(不可用于平末端和T/A克隆);需要ATP(通常包含在buffer中)。
四、Ampligase Thermostable DNA Ligase
作用:该酶可催化在高温下稳定的双链DNA结构中相邻的3'羟基化和5'磷酸化末端的NAD依赖性连接。
特点:在65℃条件下的半衰期为48小时,95℃条件下的半衰期为1小时以上。它在500个热循环(94°C/80℃)或16小时循环中具有活性,可实现极高的杂交严密性和连接特异性。对于blunt-end底物没有活性;2或4个碱基的粘性末端底物有较低的反应活性。
五、E. coli DNA Ligase
作用:以NAD+为辅因子,可以在dsDNA之间催化3'羟基端和5'磷酸端形成磷酸二酯键。
特点:与T4 DNA ligase不同的是,E.coli DNA ligase对RNA的接受性差且对平末端底物DNA无明显连接活性,对黏性末端DNA连接或切刻修复具有高特异性。需要NAD(通常包含在buffer中);可应用于cDNA合成。
六、Taq DNA Ligase
作用:能催化与同一互补靶DNA链杂交的两条相邻寡核苷酸链的5’-磷酸和3’-羟基之间形成磷酸二酯键。该催化反应只有当两条寡核苷酸链与互补靶DNA完全配对,且两条寡核苷酸链之间没有间隙的条件下才会发生,
特点:Taq DNA Ligase使用NAD作为辅因子,它在高温下很活跃(37°C~75°C)Taq DNA连接酶不会连接4碱基末端产物(比如,典型的限制酶消化产物),但能够有效地连接12碱基对突出的末端。
七、SplintRe Ligase
作用:有效催化由互补RNA链夹板夹住的相邻单链DNA的连接。该酶的强大活性及其对RNA夹板DNA底物的亲和力(表观Km=1nM)能够对复杂混合物中的独特RNA物种进行亚纳摩尔检测。
特点:连接具有互补RNA链的相邻ssDNA。可应用于基于挂锁探针的micro RNA检测,RASL-seq,SNP或可变剪切体检测。
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